Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDK13Q14004 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
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