Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.54■■■■■ 6.32
CDK13Q14004 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.82■■■■■ 6.21
CDK13Q14004 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
CDK13Q14004 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.05■■■■■ 6.08
CDK13Q14004 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
CDK13Q14004 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.51■■■■■ 6
CDK13Q14004 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
CDK13Q14004 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.14■■■■■ 5.94
CDK13Q14004 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.52■■■■■ 5.84
CDK13Q14004 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.36■■■■■ 5.81
CDK13Q14004 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
CDK13Q14004 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.33■■■■■ 5.81
CDK13Q14004 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
CDK13Q14004 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
CDK13Q14004 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
CDK13Q14004 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.89■■■■■ 5.74
CDK13Q14004 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
CDK13Q14004 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
CDK13Q14004 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CDK13Q14004 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
CDK13Q14004 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.06■■■■■ 5.6
CDK13Q14004 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.04■■■■■ 5.6
CDK13Q14004 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
CDK13Q14004 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
CDK13Q14004 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
CDK13Q14004 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
CDK13Q14004 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.73■■■■■ 5.55
CDK13Q14004 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
CDK13Q14004 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.55■■■■■ 5.52
CDK13Q14004 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.5■■■■■ 5.51
CDK13Q14004 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
CDK13Q14004 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.34■■■■■ 5.49
CDK13Q14004 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CDK13Q14004 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CDK13Q14004 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.88■■■■■ 5.42
CDK13Q14004 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.88■■■■■ 5.41
CDK13Q14004 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.76■■■■■ 5.4
CDK13Q14004 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
CDK13Q14004 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
CDK13Q14004 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
CDK13Q14004 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
CDK13Q14004 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
CDK13Q14004 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CDK13Q14004 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
CDK13Q14004 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
CDK13Q14004 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
CDK13Q14004 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
CDK13Q14004 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
CDK13Q14004 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
CDK13Q14004 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
CDK13Q14004 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
CDK13Q14004 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
CDK13Q14004 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.52■■■■■ 5.2
CDK13Q14004 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
CDK13Q14004 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
CDK13Q14004 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
CDK13Q14004 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CDK13Q14004 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.16
CDK13Q14004 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
CDK13Q14004 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
CDK13Q14004 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CDK13Q14004 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
CDK13Q14004 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
CDK13Q14004 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
CDK13Q14004 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
CDK13Q14004 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
CDK13Q14004 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.13
CDK13Q14004 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
CDK13Q14004 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CDK13Q14004 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.02■■■■■ 5.12
CDK13Q14004 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
CDK13Q14004 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
CDK13Q14004 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CDK13Q14004 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
CDK13Q14004 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CDK13Q14004 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CDK13Q14004 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CDK13Q14004 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CDK13Q14004 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CDK13Q14004 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CDK13Q14004 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CDK13Q14004 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CDK13Q14004 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CDK13Q14004 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
CDK13Q14004 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
CDK13Q14004 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
CDK13Q14004 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
CDK13Q14004 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
CDK13Q14004 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CDK13Q14004 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
CDK13Q14004 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CDK13Q14004 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CDK13Q14004 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CDK13Q14004 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
CDK13Q14004 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.38■■■■■ 5.02
CDK13Q14004 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
CDK13Q14004 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
CDK13Q14004 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CDK13Q14004 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CDK13Q14004 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
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