RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618673.4

SYTL1-211, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-211ENST00000618673 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.55■■■■■ 5.04
SYTL1-211ENST00000618673 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.62■■■■■ 4.09
SYTL1-211ENST00000618673 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
SYTL1-211ENST00000618673 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.54■■■■□ 3.76
SYTL1-211ENST00000618673 ABCC9O60706 1549 aa38.36■■■■□ 3.73
SYTL1-211ENST00000618673 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.36■■■■□ 3.73
SYTL1-211ENST00000618673 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.1■■■■□ 3.69
SYTL1-211ENST00000618673 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.88■■■■□ 3.65
SYTL1-211ENST00000618673 NACADO15069 1562 aa37.84■■■■□ 3.65
SYTL1-211ENST00000618673 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.51■■■■□ 3.6
SYTL1-211ENST00000618673 SCRIBQ14160 1630 aa37.31■■■■□ 3.56
SYTL1-211ENST00000618673 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.67■■■■□ 3.46
SYTL1-211ENST00000618673 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
SYTL1-211ENST00000618673 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.35■■■■□ 3.41
SYTL1-211ENST00000618673 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.383e-6■■□□□ 12.4
SYTL1-211ENST00000618673 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.14■■■■□ 3.38
SYTL1-211ENST00000618673 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
SYTL1-211ENST00000618673 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
SYTL1-211ENST00000618673 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.94■■■■□ 3.34
SYTL1-211ENST00000618673 SMARCA4P51532 1647 aa35.78■■■■□ 3.32
SYTL1-211ENST00000618673 WIZO95785 1651 aa35.63■■■■□ 3.29
SYTL1-211ENST00000618673 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.38■■■■□ 3.25
SYTL1-211ENST00000618673 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
SYTL1-211ENST00000618673 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
SYTL1-211ENST00000618673 SMARCA2P51531 1590 aa35.21■■■■□ 3.23
SYTL1-211ENST00000618673 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.2■■■■□ 3.23
SYTL1-211ENST00000618673 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
SYTL1-211ENST00000618673 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.92■■■■□ 3.18
SYTL1-211ENST00000618673 NCAPD3P42695 1498 aa34.92■■■■□ 3.18
SYTL1-211ENST00000618673 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.91■■■■□ 3.18
SYTL1-211ENST00000618673 HMGXB3Q12766 1538 aa34.88■■■■□ 3.17
SYTL1-211ENST00000618673 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.73■■■■□ 3.15
SYTL1-211ENST00000618673 TRIM41Q8WV44 630 aa34.31■■■■□ 3.08
SYTL1-211ENST00000618673 ABCC8Q09428 1581 aa34.16■■■■□ 3.06
SYTL1-211ENST00000618673 CFTRP13569 1480 aa34.14■■■■□ 3.06
SYTL1-211ENST00000618673 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.02■■■■□ 3.04
SYTL1-211ENST00000618673 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.99■■■■□ 3.03
SYTL1-211ENST00000618673 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.99■■■■□ 3.03
SYTL1-211ENST00000618673 PRDM2Q13029 1718 aa33.93■■■■□ 3.02
SYTL1-211ENST00000618673 SYNJ1O43426 1573 aa33.83■■■■□ 3.01
SYTL1-211ENST00000618673 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.73■■■□□ 2.99
SYTL1-211ENST00000618673 TOP2BQ02880 1626 aa33.72■■■□□ 2.99
SYTL1-211ENST00000618673 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.68■■■□□ 2.98
SYTL1-211ENST00000618673 NESP48681 1621 aa33.67■■■□□ 2.98
SYTL1-211ENST00000618673 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.63■■■□□ 2.97
SYTL1-211ENST00000618673 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
SYTL1-211ENST00000618673 CUX1P39880 1505 aa33.62■■■□□ 2.97
SYTL1-211ENST00000618673 EEA1Q15075 1411 aa33.54■■■□□ 2.96
SYTL1-211ENST00000618673 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.53■■■□□ 2.96
SYTL1-211ENST00000618673 SOGA1O94964 1423 aa33.52■■■□□ 2.96
SYTL1-211ENST00000618673 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.48■■■□□ 2.95
SYTL1-211ENST00000618673 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.43■■■□□ 2.94
SYTL1-211ENST00000618673 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.38■■■□□ 2.93
SYTL1-211ENST00000618673 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.35■■■□□ 2.93
SYTL1-211ENST00000618673 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.3■■■□□ 2.92
SYTL1-211ENST00000618673 TOPBP1Q92547 1522 aa33.26■■■□□ 2.92
SYTL1-211ENST00000618673 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.26■■■□□ 2.92
SYTL1-211ENST00000618673 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.26■■■□□ 2.91
SYTL1-211ENST00000618673 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
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SYTL1-211ENST00000618673 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
SYTL1-211ENST00000618673 KIF21BO75037 1637 aa33.07■■■□□ 2.89
SYTL1-211ENST00000618673 GOLGA3Q08378 1498 aa33.05■■■□□ 2.88
SYTL1-211ENST00000618673 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.05■■■□□ 2.88
SYTL1-211ENST00000618673 CUX2O14529 1486 aa33.04■■■□□ 2.88
SYTL1-211ENST00000618673 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.99■■■□□ 2.87
SYTL1-211ENST00000618673 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.97■■■□□ 2.87
SYTL1-211ENST00000618673 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.93■■■□□ 2.86
SYTL1-211ENST00000618673 ERCC6Q03468 1493 aa32.92■■■□□ 2.86
SYTL1-211ENST00000618673 PRXQ9BXM0 1461 aa32.92■■■□□ 2.86
SYTL1-211ENST00000618673 WDR62O43379 1518 aa32.88■■■□□ 2.85
SYTL1-211ENST00000618673 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.87■■■□□ 2.85
SYTL1-211ENST00000618673 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.86■■■□□ 2.85
SYTL1-211ENST00000618673 WDR97A6NE52 1622 aa32.86■■■□□ 2.85
SYTL1-211ENST00000618673 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
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SYTL1-211ENST00000618673 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
SYTL1-211ENST00000618673 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.76■■■□□ 2.83
SYTL1-211ENST00000618673 CEP162Q5TB80 1403 aa32.74■■■□□ 2.83
SYTL1-211ENST00000618673 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.71■■■□□ 2.83
SYTL1-211ENST00000618673 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.67■■■□□ 2.82
SYTL1-211ENST00000618673 IFT140Q96RY7 1462 aa32.65■■■□□ 2.82
SYTL1-211ENST00000618673 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
SYTL1-211ENST00000618673 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.64■■■□□ 2.81
SYTL1-211ENST00000618673 CUL7Q14999 1698 aa32.6■■■□□ 2.81
SYTL1-211ENST00000618673 CLIP1P30622 1438 aa32.5■■■□□ 2.79
SYTL1-211ENST00000618673 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.44■■■□□ 2.786e-7■■■■□ 25.4
SYTL1-211ENST00000618673 PBRM1Q86U86 1689 aa32.43■■■□□ 2.78
SYTL1-211ENST00000618673 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
SYTL1-211ENST00000618673 GRIN2BQ13224 1484 aa32.4■■■□□ 2.78
SYTL1-211ENST00000618673 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
SYTL1-211ENST00000618673 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.3■■■□□ 2.76
SYTL1-211ENST00000618673 ADAMTS12P58397 1594 aa32.29■■■□□ 2.76
SYTL1-211ENST00000618673 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
SYTL1-211ENST00000618673 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.23■■■□□ 2.75
SYTL1-211ENST00000618673 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.2■■■□□ 2.75
SYTL1-211ENST00000618673 ARAP1Q96P48 1450 aa32.18■■■□□ 2.74
SYTL1-211ENST00000618673 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.18■■■□□ 2.74
SYTL1-211ENST00000618673 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.17■■■□□ 2.74
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