Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms