Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.151e-10■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-10■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.681e-10■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.341e-10■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 HLA-C-204ENST00000415537 782 nt27.34■■□□□ 1.971e-8■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 HLA-C-209ENST00000495835 1073 nt26.51■■□□□ 1.831e-8■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.045e-8■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-8■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.25e-8■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.325e-8■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.21□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 9.6
NOLC1Q14978 SNRNP200-202ENST00000429650 2637 ntTSL 215.75■□□□□ 0.111e-25■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 SNRNP200-208ENST00000497539 2666 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.241e-25■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.519e-7■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 UBE2G2-206ENST00000481546 4340 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.749e-7■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 C2-210ENST00000468407 694 ntTSL 212.23□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)22.76■■□□□ 1.231e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.731e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-222ENST00000567024 525 ntTSL 319.17■□□□□ 0.661e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-213ENST00000564162 770 ntTSL 519.03■□□□□ 0.641e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.521e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.391e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 517.12■□□□□ 0.331e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.081e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.095e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.595e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-202ENST00000503605 595 ntTSL 318.61■□□□□ 0.575e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.015e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.025e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.275e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-203ENST00000504293 576 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.915e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.165e-36■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-12■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 SERPINF1-203ENST00000570820 820 ntTSL 214.68□□□□□ -0.065e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.263e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 221.39■■□□□ 1.023e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PSMD12-207ENST00000584008 1752 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.83e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PSMD4-205ENST00000445776 703 ntTSL 318.76■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PSMD4-203ENST00000427779 649 ntTSL 318.48■□□□□ 0.553e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 216.99■□□□□ 0.313e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 NDUFB5-203ENST00000468210 824 ntTSL 215.91■□□□□ 0.143e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 HADHA-204ENST00000492433 752 ntTSL 211.25□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PSMD4-206ENST00000453615 371 ntTSL 39.39□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 NDUFB5-207ENST00000476587 635 ntTSL 27.18□□□□□ -1.263e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 AP3S1-202ENST00000395548 1180 ntTSL 1 (best)6.1□□□□□ -1.433e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 AP3S1-203ENST00000505423 611 ntTSL 24.82□□□□□ -1.643e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.199e-12■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.129e-12■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 HLA-C-207ENST00000484378 862 nt31.07■■■□□ 2.562e-19■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.283e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 522.27■■□□□ 1.163e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 EPHX1-203ENST00000445856 567 ntTSL 222.21■■□□□ 1.153e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.053e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 EPHX1-204ENST00000448202 895 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.643e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 FLNA-208ENST00000438732 696 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.393e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 STT3A-210ENST00000527606 569 ntTSL 416.95■□□□□ 0.33e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RNASE4-202ENST00000555597 1341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 VTN-203ENST00000542029 501 ntTSL 312.46□□□□□ -0.416e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 39.98□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 STT3A-204ENST00000525652 607 ntTSL 28.5□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 STT3A-212ENST00000529886 542 ntTSL 46.02□□□□□ -1.453e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 EPHX1-205ENST00000467015 455 ntTSL 25.66□□□□□ -1.53e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 LMAN1-204ENST00000587940 442 ntTSL 24.48□□□□□ -1.693e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ANG-203ENST00000554073 251 ntTSL 32.9□□□□□ -1.953e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.764e-7■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.085e-7■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.185e-7■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 FGB-204ENST00000497097 574 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.381e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 FGB-202ENST00000425838 565 ntTSL 411.32□□□□□ -0.61e-11■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 223.15■■□□□ 1.39e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.569e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.719e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPL27-202ENST00000586277 460 ntTSL 39.2□□□□□ -0.949e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPL27-204ENST00000588830 318 ntTSL 28.68□□□□□ -1.029e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.039e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.569e-10■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 529.08■■■□□ 2.253e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 225.27■■□□□ 1.643e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.193e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.183e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 220.59■□□□□ 0.893e-13■□□□□ 9.5
NOLC1Q14978 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 219.94■□□□□ 0.783e-13■□□□□ 9.5
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