Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 9.4
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TRA2AQ13595 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 214.84□□□□□ -0.034e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.144e-6■□□□□ 9.4
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TRA2AQ13595 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 512.8□□□□□ -0.364e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 NOP56-204ENST00000460258 837 ntTSL 412.74□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 211.02□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 9.4
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TRA2AQ13595 ING5-207ENST00000484145 351 ntTSL 34.89□□□□□ -1.634e-6■□□□□ 9.4
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TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.361e-8■□□□□ 9.3
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TRA2AQ13595 PPME1-204ENST00000538501 744 ntTSL 1 (best)6.86□□□□□ -1.312e-6■□□□□ 9.3
TRA2AQ13595 PPME1-203ENST00000535205 636 ntTSL 26.67□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 9.3
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TRA2AQ13595 DDX41-217ENST00000515562 1184 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.361e-6■□□□□ 9.3
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TRA2AQ13595 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 59.51□□□□□ -0.895e-87■□□□□ 9.3
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TRA2AQ13595 EIF4A1-204ENST00000577731 574 ntTSL 22.91□□□□□ -1.945e-87■□□□□ 9.3
TRA2AQ13595 DDX5-208ENST00000578491 463 ntTSL 25.31□□□□□ -1.568e-8■□□□□ 9.3
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TRA2AQ13595 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 518■□□□□ 0.471e-7■□□□□ 9.3
TRA2AQ13595 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.321e-7■□□□□ 9.3
TRA2AQ13595 A2M-202ENST00000404455 623 ntTSL 55.36□□□□□ -1.551e-7■□□□□ 9.3
TRA2AQ13595 A2M-209ENST00000539638 590 ntTSL 45.36□□□□□ -1.551e-7■□□□□ 9.3
TRA2AQ13595 SEM1-209ENST00000482389 2773 ntTSL 21.78□□□□□ -2.121e-7■□□□□ 9.3
TRA2AQ13595 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 512.01□□□□□ -0.494e-7■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 211.64□□□□□ -0.556e-9■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 210.25□□□□□ -0.776e-9■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 SLTM-214ENST00000558052 806 ntTSL 25.96□□□□□ -1.465e-7■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 DDX5-209ENST00000578758 667 ntTSL 29.49□□□□□ -0.892e-11■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-10■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 27.15□□□□□ -1.261e-10■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.311e-10■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 ABCF1-207ENST00000542772 223 ntTSL 35.66□□□□□ -1.53e-7■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 9.2
TRA2AQ13595 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 223.27■■□□□ 1.326e-7■□□□□ 9.2
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