Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUPL2O15504 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms