RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.62■■■■■ 4.89
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.77■■■■□ 3.96
PACSIN3-211ENST00000539589 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC9O60706 1549 aa37.71■■■■□ 3.63
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.68■■■■□ 3.62
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.66■■■■□ 3.62
PACSIN3-211ENST00000539589 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.22■■■■□ 3.55
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.22■■■■□ 3.55
PACSIN3-211ENST00000539589 NACADO15069 1562 aa37.03■■■■□ 3.52
PACSIN3-211ENST00000539589 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.73■■■■□ 3.47
PACSIN3-211ENST00000539589 SCRIBQ14160 1630 aa36.63■■■■□ 3.45
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.16■■■■□ 3.38
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
PACSIN3-211ENST00000539589 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.74■■■■□ 3.31
PACSIN3-211ENST00000539589 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.299e-7■□□□□ 8.3
PACSIN3-211ENST00000539589 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.52■■■■□ 3.28
PACSIN3-211ENST00000539589 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.29■■■■□ 3.24
PACSIN3-211ENST00000539589 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCA4P51532 1647 aa35.09■■■■□ 3.21
PACSIN3-211ENST00000539589 WIZO95785 1651 aa35.02■■■■□ 3.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.64■■■■□ 3.14
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
PACSIN3-211ENST00000539589 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
PACSIN3-211ENST00000539589 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.52■■■■□ 3.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCA2P51531 1590 aa34.44■■■■□ 3.1
PACSIN3-211ENST00000539589 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.26■■■■□ 3.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.26■■■■□ 3.07
PACSIN3-211ENST00000539589 NCAPD3P42695 1498 aa34.2■■■■□ 3.07
PACSIN3-211ENST00000539589 HMGXB3Q12766 1538 aa34.14■■■■□ 3.06
PACSIN3-211ENST00000539589 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.14■■■■□ 3.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM41Q8WV44 630 aa33.57■■■□□ 2.96
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC8Q09428 1581 aa33.56■■■□□ 2.96
PACSIN3-211ENST00000539589 CFTRP13569 1480 aa33.44■■■□□ 2.94
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.42■■■□□ 2.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.32■■■□□ 2.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PRDM2Q13029 1718 aa33.31■■■□□ 2.92
PACSIN3-211ENST00000539589 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.26■■■□□ 2.91
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNJ1O43426 1573 aa33.2■■■□□ 2.91
PACSIN3-211ENST00000539589 NESP48681 1621 aa33.14■■■□□ 2.9
PACSIN3-211ENST00000539589 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.04■■■□□ 2.88
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.03■■■□□ 2.88
PACSIN3-211ENST00000539589 TOP2BQ02880 1626 aa33.03■■■□□ 2.88
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
PACSIN3-211ENST00000539589 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.01■■■□□ 2.87
PACSIN3-211ENST00000539589 CUX1P39880 1505 aa32.99■■■□□ 2.87
PACSIN3-211ENST00000539589 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.96■■■□□ 2.87
PACSIN3-211ENST00000539589 SOGA1O94964 1423 aa32.9■■■□□ 2.86
PACSIN3-211ENST00000539589 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.83■■■□□ 2.85
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.74■■■□□ 2.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.74■■■□□ 2.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.73■■■□□ 2.83
PACSIN3-211ENST00000539589 EEA1Q15075 1411 aa32.68■■■□□ 2.82
PACSIN3-211ENST00000539589 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.66■■■□□ 2.82
PACSIN3-211ENST00000539589 TOPBP1Q92547 1522 aa32.62■■■□□ 2.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.61■■■□□ 2.81
PACSIN3-211ENST00000539589 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
PACSIN3-211ENST00000539589 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.59■■■□□ 2.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.58■■■□□ 2.81
PACSIN3-211ENST00000539589 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.39■■■□□ 2.78
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF27Q86VH2 1401 aa32.39■■■□□ 2.78
PACSIN3-211ENST00000539589 CUX2O14529 1486 aa32.37■■■□□ 2.77
PACSIN3-211ENST00000539589 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.36■■■□□ 2.77
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF21BO75037 1637 aa32.34■■■□□ 2.77
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.3■■■□□ 2.76
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA3Q08378 1498 aa32.29■■■□□ 2.76
PACSIN3-211ENST00000539589 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.27■■■□□ 2.76
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR97A6NE52 1622 aa32.26■■■□□ 2.75
PACSIN3-211ENST00000539589 ERCC6Q03468 1493 aa32.26■■■□□ 2.75
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR62O43379 1518 aa32.22■■■□□ 2.75
PACSIN3-211ENST00000539589 PRXQ9BXM0 1461 aa32.22■■■□□ 2.75
PACSIN3-211ENST00000539589 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.22■■■□□ 2.75
PACSIN3-211ENST00000539589 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
PACSIN3-211ENST00000539589 IGF1RP08069 1367 aa32.18■■■□□ 2.74
PACSIN3-211ENST00000539589 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.18■■■□□ 2.74
PACSIN3-211ENST00000539589 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
PACSIN3-211ENST00000539589 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
PACSIN3-211ENST00000539589 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.12■■■□□ 2.73
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.07■■■□□ 2.72
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
PACSIN3-211ENST00000539589 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP162Q5TB80 1403 aa32.03■■■□□ 2.72
PACSIN3-211ENST00000539589 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.98■■■□□ 2.71
PACSIN3-211ENST00000539589 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.97■■■□□ 2.71
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT140Q96RY7 1462 aa31.94■■■□□ 2.7
PACSIN3-211ENST00000539589 CUL7Q14999 1698 aa31.89■■■□□ 2.7
PACSIN3-211ENST00000539589 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.88■■■□□ 2.699e-7■■■■□ 19.7
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
PACSIN3-211ENST00000539589 HRCP23327 699 aa31.87■■■□□ 2.69
PACSIN3-211ENST00000539589 PBRM1Q86U86 1689 aa31.85■■■□□ 2.69
PACSIN3-211ENST00000539589 CLIP1P30622 1438 aa31.78■■■□□ 2.68
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIN2BQ13224 1484 aa31.71■■■□□ 2.67
PACSIN3-211ENST00000539589 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS12P58397 1594 aa31.64■■■□□ 2.66
PACSIN3-211ENST00000539589 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.6■■■□□ 2.65
PACSIN3-211ENST00000539589 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.59■■■□□ 2.65
PACSIN3-211ENST00000539589 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.55■■■□□ 2.64
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