Protein–RNA interactions for Protein: C9J7I0

UMAD1, UBAP1-MVB12-associated (UMA)-domain containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMAD1C9J7I0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UMAD1C9J7I0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms