Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EXTL2Q9UBQ6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EXTL2Q9UBQ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms