Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GRK2-212ENST00000532611 410 ntTSL 511.88□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 CAPRIN1-213ENST00000533562 591 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 ALAD-207ENST00000482001 562 ntTSL 411.06□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GALM-201ENST00000272252 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 POLR3D-203ENST00000517789 841 ntTSL 510.58□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SEC16A-204ENST00000313084 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SPAG5-203ENST00000536674 870 ntTSL 310.27□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RPL24-203ENST00000469605 799 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 210.03□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RPL24-204ENST00000470961 572 ntTSL 29.73□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SPAG5-210ENST00000580567 899 ntTSL 39.52□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SPAG5-206ENST00000578479 904 ntTSL 39.52□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-204ENST00000411894 588 ntTSL 59.05□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-205ENST00000429339 480 ntTSL 59.05□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 58.81□□□□□ -11e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 SMTN-209ENST00000432777 567 ntTSL 38.23□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MMS19-215ENST00000478452 835 ntTSL 28.15□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 IARS2-204ENST00000490891 447 ntTSL 37.89□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RPL24-202ENST00000464595 668 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RAE1-206ENST00000452119 691 ntTSL 37.8□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RNF213-213ENST00000571908 624 ntTSL 27.09□□□□□ -1.273e-8■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 PDE7A-207ENST00000522220 1081 ntTSL 26.67□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 MMADHC-204ENST00000460311 324 ntTSL 26.45□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 FAM91A1-202ENST00000517912 681 ntTSL 36.14□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 FAM91A1-205ENST00000519721 4650 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GALM-204ENST00000434934 724 ntTSL 33.89□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 PDE7A-204ENST00000518667 802 ntTSL 33.69□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 GRK2-208ENST00000529815 589 ntTSL 211.7□□□□□ -0.544e-11■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.541e-36■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 517.78■□□□□ 0.441e-36■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.071e-36■■■■■ 39.6
EFTUD2Q15029 PNKP-202ENST00000593706 849 ntTSL 313.71□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 NT5DC2-205ENST00000463947 670 ntTSL 312.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 STRN4-211ENST00000595357 1602 ntTSL 216.99■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 CIRBP-234ENST00000591659 587 ntTSL 219.42■□□□□ 0.71e-27■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 UNC13D-212ENST00000589670 668 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 UNC13D-206ENST00000586519 403 ntTSL 516.02■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-203ENST00000558046 3440 ntTSL 212.66□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-218ENST00000561199 3249 ntTSL 212.63□□□□□ -0.396e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-214ENST00000560798 3581 ntTSL 212.56□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-207ENST00000558780 3540 ntTSL 212.53□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 AL136295.4-201ENST00000561419 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-211ENST00000560155 3485 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-217ENST00000561090 3632 ntTSL 211.71□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-201ENST00000354464 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-209ENST00000559588 3537 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 IPO4-219ENST00000561379 624 ntTSL 413.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.737e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 RPS6KA1-219ENST00000531113 2089 ntTSL 211.85□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 RPS6KA1-202ENST00000374163 3202 ntTSL 211.16□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 PRKCD-206ENST00000487897 562 ntTSL 416.08■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 ZNF37A-204ENST00000479469 1148 ntTSL 513.84□□□□□ -0.197e-16■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.437e-16■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 ZDHHC6-205ENST00000626395 2906 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.797e-16■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.017e-16■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.157e-16■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 SLC4A2-209ENST00000472204 994 ntTSL 514.14□□□□□ -0.156e-12■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 PANK4-206ENST00000487804 718 ntTSL 319.07■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 39.5
EFTUD2Q15029 AC005726.2-202ENST00000531839 1033 ntAPPRIS P5 TSL 211.41□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 SMARCD1-203ENST00000547247 1584 ntTSL 1 (best)22.71■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 SMARCD1-209ENST00000550477 911 ntTSL 321.49■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 SMARCD1-204ENST00000547637 587 ntTSL 221.49■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 SMARCD1-212ENST00000551966 881 ntTSL 519.95■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 SMARCD1-211ENST00000551497 536 ntTSL 414.77□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 KIF22-210ENST00000570173 562 ntTSL 511.47□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 FAM160B2-206ENST00000474579 431 ntTSL 315.41■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.815e-9■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 KSR1-202ENST00000398982 2048 ntTSL 515.8■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-9■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 KSR1-214ENST00000581975 737 ntTSL 59.51□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 DPH1-207ENST00000571710 2013 ntTSL 1 (best)20.78■□□□□ 0.921e-8■■■■■ 39.4
EFTUD2Q15029 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.555e-8■■■■■ 39.3
EFTUD2Q15029 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.215e-8■■■■■ 39.3
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