Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 227.01■■□□□ 1.923e-7■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 524.09■■□□□ 1.453e-7■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-7■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-11■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 PFDN5-207ENST00000549759 559 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-11■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 PFDN5-204ENST00000547130 559 ntTSL 214.59□□□□□ -0.072e-11■■■■□ 23.3
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PABPC4Q13310 PFDN5-218ENST00000552742 571 ntTSL 311.7□□□□□ -0.542e-11■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.782e-11■■■■□ 23.3
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PABPC4Q13310 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-11■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 NPM3-204ENST00000474993 755 ntTSL 223.91■■□□□ 1.423e-8■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.183e-8■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-12■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 UBE2G2-206ENST00000481546 4340 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.843e-12■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 SNX17-203ENST00000440760 1955 ntTSL 1 (best)21.44■■□□□ 1.029e-12■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 SNX17-202ENST00000427123 2007 ntTSL 221.28■■□□□ 19e-12■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.959e-12■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.79e-12■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 SNX17-204ENST00000453453 1638 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.479e-12■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-6■■■■□ 23.3
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PABPC4Q13310 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23.3
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PABPC4Q13310 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.444e-9■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.374e-9■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 CD55-209ENST00000488171 1389 ntTSL 323.45■■□□□ 1.344e-9■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 CD55-202ENST00000343420 978 ntTSL 520.48■□□□□ 0.874e-9■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 CHD8-214ENST00000557727 1146 nt10.55□□□□□ -0.728e-7■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -18e-7■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.358e-7■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 CCNB1-207ENST00000513102 463 ntTSL 25.01□□□□□ -1.613e-11■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.896e-10■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.776e-10■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.526e-10■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 POR-212ENST00000447222 2332 ntTSL 517.97■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.674e-8■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 PHF19-204ENST00000436309 558 ntTSL 414.21□□□□□ -0.134e-19■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.654e-19■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-7■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-7■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.625e-12■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.839e-7■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 MAPK3-207ENST00000466521 1878 ntTSL 532.73■■■□□ 2.839e-7■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 MAPK3-214ENST00000490298 1718 ntTSL 531.66■■■□□ 2.669e-7■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 ANAPC16-205ENST00000621663 3567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-10■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-10■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.874e-6■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 23.2
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PABPC4Q13310 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 217.74■□□□□ 0.438e-14■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.022e-21■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.872e-21■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 FBXW5-207ENST00000487794 1932 ntTSL 1 (best)23.29■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.692e-22■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 325.51■■□□□ 1.672e-22■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.122e-22■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 UBE2J2-212ENST00000467339 515 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-22■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 321.19■□□□□ 0.984e-8■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.934e-8■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.574e-8■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 PAM16-206ENST00000573236 704 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.574e-8■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-8■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 PAM16-207ENST00000573450 579 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-8■■■■□ 23.2
PABPC4Q13310 DNAJC4-208ENST00000540945 703 ntTSL 222.51■■□□□ 1.198e-8■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 39.6□□□□□ -0.876e-19■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 METTL26-207ENST00000456420 755 ntTSL 320.3■□□□□ 0.846e-10■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 ATP5B-208ENST00000551182 457 ntTSL 28.1□□□□□ -1.116e-69■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.697e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.517e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.467e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 23.1
PABPC4Q13310 PCNX3-202ENST00000439247 3104 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 23.1
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