Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms