Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC15Q0P6D6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC15Q0P6D6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms