Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNNM4Q6P4Q7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM4Q6P4Q7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms