Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZMYND8Q9ULU4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ZMYND8Q9ULU4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZMYND8Q9ULU4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZMYND8Q9ULU4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZMYND8Q9ULU4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZMYND8Q9ULU4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZMYND8Q9ULU4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms