Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV2

SEL1L, Protein sel-1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1LQ9UBV2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEL1LQ9UBV2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEL1LQ9UBV2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEL1LQ9UBV2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEL1LQ9UBV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEL1LQ9UBV2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEL1LQ9UBV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEL1LQ9UBV2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEL1LQ9UBV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEL1LQ9UBV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEL1LQ9UBV2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEL1LQ9UBV2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEL1LQ9UBV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEL1LQ9UBV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms