Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XCL2Q9UBD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XCL2Q9UBD3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
XCL2Q9UBD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms