Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DPM3Q9P2X0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPM3Q9P2X0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DPM3Q9P2X0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPM3Q9P2X0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DPM3Q9P2X0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms