Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMURF1Q9HCE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMURF1Q9HCE7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMURF1Q9HCE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMURF1Q9HCE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMURF1Q9HCE7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMURF1Q9HCE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms