Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LY9Q9HBG7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LY9Q9HBG7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LY9Q9HBG7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LY9Q9HBG7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LY9Q9HBG7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LY9Q9HBG7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LY9Q9HBG7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LY9Q9HBG7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LY9Q9HBG7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
LY9Q9HBG7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LY9Q9HBG7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LY9Q9HBG7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms