Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
LY9Q9HBG7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
LY9Q9HBG7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
LY9Q9HBG7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LY9Q9HBG7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
LY9Q9HBG7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
LY9Q9HBG7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
LY9Q9HBG7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
LY9Q9HBG7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
LY9Q9HBG7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
LY9Q9HBG7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
LY9Q9HBG7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LY9Q9HBG7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
LY9Q9HBG7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LY9Q9HBG7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LY9Q9HBG7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LY9Q9HBG7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LY9Q9HBG7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LY9Q9HBG7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LY9Q9HBG7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LY9Q9HBG7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LY9Q9HBG7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
LY9Q9HBG7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LY9Q9HBG7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LY9Q9HBG7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LY9Q9HBG7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LY9Q9HBG7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LY9Q9HBG7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LY9Q9HBG7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LY9Q9HBG7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LY9Q9HBG7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LY9Q9HBG7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
LY9Q9HBG7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LY9Q9HBG7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LY9Q9HBG7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
LY9Q9HBG7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
LY9Q9HBG7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LY9Q9HBG7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LY9Q9HBG7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
LY9Q9HBG7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
LY9Q9HBG7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
LY9Q9HBG7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LY9Q9HBG7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
LY9Q9HBG7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LY9Q9HBG7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LY9Q9HBG7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LY9Q9HBG7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LY9Q9HBG7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LY9Q9HBG7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LY9Q9HBG7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LY9Q9HBG7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LY9Q9HBG7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LY9Q9HBG7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LY9Q9HBG7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LY9Q9HBG7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LY9Q9HBG7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LY9Q9HBG7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LY9Q9HBG7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
LY9Q9HBG7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LY9Q9HBG7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LY9Q9HBG7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LY9Q9HBG7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LY9Q9HBG7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LY9Q9HBG7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LY9Q9HBG7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LY9Q9HBG7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LY9Q9HBG7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LY9Q9HBG7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
LY9Q9HBG7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LY9Q9HBG7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LY9Q9HBG7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LY9Q9HBG7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LY9Q9HBG7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LY9Q9HBG7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LY9Q9HBG7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LY9Q9HBG7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LY9Q9HBG7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LY9Q9HBG7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LY9Q9HBG7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LY9Q9HBG7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LY9Q9HBG7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LY9Q9HBG7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
LY9Q9HBG7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LY9Q9HBG7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LY9Q9HBG7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LY9Q9HBG7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LY9Q9HBG7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LY9Q9HBG7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LY9Q9HBG7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LY9Q9HBG7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LY9Q9HBG7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LY9Q9HBG7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LY9Q9HBG7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LY9Q9HBG7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LY9Q9HBG7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
LY9Q9HBG7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LY9Q9HBG7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LY9Q9HBG7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LY9Q9HBG7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LY9Q9HBG7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms