Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
KRT23Q9C075 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KRT23Q9C075 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KRT23Q9C075 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT23Q9C075 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT23Q9C075 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
KRT23Q9C075 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KRT23Q9C075 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KRT23Q9C075 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms