Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ67

GRWD1, Glutamate-rich WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.577e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.567e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.447e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.367e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-209ENST00000487279 2786 ntTSL 1 (best)21.32■■□□□ 17e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-207ENST00000471408 2843 ntTSL 218.73■□□□□ 0.597e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.487e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-210ENST00000488007 3001 ntTSL 517.65■□□□□ 0.427e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 TARS-208ENST00000506040 755 ntTSL 517.86■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.331e-14■■■■■ 29
GRWD1Q9BQ67 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 512.65□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 28.9
GRWD1Q9BQ67 WDR27-206ENST00000474018 951 ntTSL 226.7■■□□□ 1.862e-10■■■■■ 28.9
GRWD1Q9BQ67 NPSR1-AS1-207ENST00000539747 830 ntTSL 217.58■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 28.9
GRWD1Q9BQ67 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 28.9
GRWD1Q9BQ67 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 MED6-208ENST00000555296 856 ntTSL 217.66■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 MED6-202ENST00000430055 1507 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 MED6-203ENST00000440435 931 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.52e-16■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 HSP90AA1-203ENST00000553585 581 ntTSL 315.5■□□□□ 0.075e-14■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 227.57■■■□□ 26e-8■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.621e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-226ENST00000570051 735 ntTSL 231.44■■■□□ 2.621e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.031e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.921e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.911e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-217ENST00000565870 1514 ntTSL 1 (best)26.3■■□□□ 1.81e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-204ENST00000561518 1092 ntTSL 526.07■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.691e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-209ENST00000564311 870 ntTSL 523.67■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 FERMT2-214ENST00000557562 555 ntTSL 336.97■■■■□ 3.511e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.891e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-203ENST00000447801 1273 ntTSL 525.91■■□□□ 1.741e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-204ENST00000468751 648 ntTSL 224.88■■□□□ 1.571e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-206ENST00000475960 477 ntTSL 319.89■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-209ENST00000486751 783 ntTSL 219.2■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-202ENST00000429912 667 ntTSL 319.2■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-208ENST00000485019 409 ntTSL 319.2■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-205ENST00000474086 882 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 RBM34-207ENST00000476261 881 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 UBTF-208ENST00000529373 674 ntTSL 232.39■■■□□ 2.781e-7■■■■■ 28.8
GRWD1Q9BQ67 HDAC6-231ENST00000488905 492 ntTSL 428.75■■■□□ 2.191e-6■■■■■ 28.7
GRWD1Q9BQ67 CNOT2-235ENST00000552151 1682 ntTSL 210.45□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 28.7
GRWD1Q9BQ67 HSP90AA1-208ENST00000557234 584 ntTSL 328.68■■■□□ 2.188e-14■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF12-202ENST00000394917 662 ntTSL 338.27■■■■□ 3.725e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.783e-7■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 CCNE1-205ENST00000575243 820 ntTSL 530.02■■■□□ 2.43e-7■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.95e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.485e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 DICER1-213ENST00000554367 897 ntTSL 423.29■■□□□ 1.325e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 MYO9B-216ENST00000601490 557 ntTSL 222.37■■□□□ 1.175e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 CCDC124-204ENST00000602080 609 ntTSL 521.67■■□□□ 1.065e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 MPHOSPH10-204ENST00000493360 1584 ntTSL 216.43■□□□□ 0.225e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 CHMP3-209ENST00000494623 2724 ntTSL 215.42■□□□□ 0.065e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF507-202ENST00000355898 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.025e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 MYO9B-217ENST00000601749 645 ntTSL 215.1■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 COG2-205ENST00000478710 629 ntTSL 214.61□□□□□ -0.075e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 NUP98-218ENST00000530516 391 ntTSL 213.07□□□□□ -0.325e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.515e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.975e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF507-205ENST00000587084 5560 ntTSL 1 (best)7.26□□□□□ -1.255e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.45e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 518.62■□□□□ 0.573e-11■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.497e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.897e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 NDUFAF7-213ENST00000483999 711 ntTSL 520.88■□□□□ 0.937e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 NEIL1-209ENST00000565121 1169 ntTSL 220.81■□□□□ 0.927e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 NEIL1-213ENST00000567393 1221 ntTSL 520.2■□□□□ 0.827e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 NDUFAF7-205ENST00000431821 783 ntTSL 420.09■□□□□ 0.817e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 RTL8C-203ENST00000495563 578 ntTSL 517.87■□□□□ 0.457e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 RTL8C-202ENST00000464369 616 ntTSL 515.53■□□□□ 0.087e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 SORBS1-218ENST00000492542 720 ntTSL 313.17□□□□□ -0.37e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 NDUFAF7-209ENST00000455230 946 ntTSL 512.94□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 NDUFAF7-207ENST00000439218 934 ntTSL 311.52□□□□□ -0.577e-9■■■■■ 28.6
GRWD1Q9BQ67 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 TCHP-206ENST00000544838 2077 ntTSL 228.59■■■□□ 2.176e-8■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 TCHP-204ENST00000537218 853 ntTSL 223.43■■□□□ 1.346e-8■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 28.5
GRWD1Q9BQ67 DNAJC2-211ENST00000492497 2167 ntTSL 215.25■□□□□ 0.031e-16■■■■■ 28.4
GRWD1Q9BQ67 BUB1B-206ENST00000558972 630 ntTSL 314.91□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 28.4
GRWD1Q9BQ67 INPPL1-206ENST00000538339 505 ntTSL 217.92■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 CCDC183-208ENST00000609471 644 ntTSL 226.5■■□□□ 1.836e-14■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 227.82■■■□□ 2.042e-9■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 NOP2-214ENST00000542867 848 ntTSL 526.39■■□□□ 1.822e-6■■■■■ 28.3
GRWD1Q9BQ67 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-9■■■■■ 28.3
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