Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG8Q96MW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG8Q96MW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG8Q96MW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG8Q96MW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG8Q96MW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG8Q96MW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG8Q96MW5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms