Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RUNDC1Q96C34 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RUNDC1Q96C34 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
RUNDC1Q96C34 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RUNDC1Q96C34 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RUNDC1Q96C34 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RUNDC1Q96C34 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
RUNDC1Q96C34 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RUNDC1Q96C34 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RUNDC1Q96C34 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RUNDC1Q96C34 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RUNDC1Q96C34 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RUNDC1Q96C34 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RUNDC1Q96C34 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms