Protein–RNA interactions for Protein: Q96AT9

RPE, Ribulose-phosphate 3-epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEQ96AT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPEQ96AT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPEQ96AT9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPEQ96AT9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPEQ96AT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPEQ96AT9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPEQ96AT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPEQ96AT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPEQ96AT9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPEQ96AT9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPEQ96AT9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPEQ96AT9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPEQ96AT9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPEQ96AT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPEQ96AT9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPEQ96AT9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPEQ96AT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPEQ96AT9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPEQ96AT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPEQ96AT9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPEQ96AT9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPEQ96AT9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPEQ96AT9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms