Protein–RNA interactions for Protein: Q96AT9

RPE, Ribulose-phosphate 3-epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEQ96AT9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPEQ96AT9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPEQ96AT9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RPEQ96AT9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPEQ96AT9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPEQ96AT9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPEQ96AT9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPEQ96AT9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPEQ96AT9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPEQ96AT9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPEQ96AT9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPEQ96AT9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPEQ96AT9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPEQ96AT9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPEQ96AT9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPEQ96AT9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPEQ96AT9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPEQ96AT9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPEQ96AT9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPEQ96AT9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPEQ96AT9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPEQ96AT9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPEQ96AT9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPEQ96AT9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPEQ96AT9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPEQ96AT9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPEQ96AT9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPEQ96AT9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPEQ96AT9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPEQ96AT9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPEQ96AT9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPEQ96AT9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPEQ96AT9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPEQ96AT9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPEQ96AT9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPEQ96AT9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPEQ96AT9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPEQ96AT9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPEQ96AT9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPEQ96AT9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPEQ96AT9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPEQ96AT9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPEQ96AT9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPEQ96AT9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPEQ96AT9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPEQ96AT9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPEQ96AT9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPEQ96AT9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPEQ96AT9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPEQ96AT9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPEQ96AT9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPEQ96AT9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPEQ96AT9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPEQ96AT9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPEQ96AT9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPEQ96AT9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPEQ96AT9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPEQ96AT9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPEQ96AT9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPEQ96AT9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPEQ96AT9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPEQ96AT9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPEQ96AT9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPEQ96AT9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPEQ96AT9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPEQ96AT9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPEQ96AT9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPEQ96AT9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPEQ96AT9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPEQ96AT9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPEQ96AT9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPEQ96AT9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPEQ96AT9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPEQ96AT9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPEQ96AT9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPEQ96AT9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPEQ96AT9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPEQ96AT9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPEQ96AT9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPEQ96AT9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPEQ96AT9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPEQ96AT9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPEQ96AT9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPEQ96AT9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPEQ96AT9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPEQ96AT9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPEQ96AT9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPEQ96AT9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPEQ96AT9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPEQ96AT9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPEQ96AT9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPEQ96AT9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms