Protein–RNA interactions for Protein: Q86U42

PABPN1, Polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1Q86U42 GALE-214ENST00000481736 1801 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 QARS-226ENST00000634359 437 ntTSL 517.77■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 NEK8-201ENST00000268766 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 MCM3AP-207ENST00000486937 4593 ntTSL 215.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 MCM3AP-210ENST00000496607 4075 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 KNTC1-202ENST00000377192 1519 ntTSL 210.27□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 KNTC1-212ENST00000541466 616 ntTSL 29.43□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 PSMC5-218ENST00000584657 576 ntTSL 215.86■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 PRICKLE4-206ENST00000483200 880 ntTSL 247.87■■■■■ 5.251e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.91e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.741e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.741e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.991e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.781e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 225.66■■□□□ 1.71e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 220.71■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 220.25■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.387e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-212ENST00000538973 1456 ntTSL 541.73■■■■■ 4.277e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.877e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 235.19■■■■□ 3.227e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-206ENST00000535830 963 ntTSL 235.09■■■■□ 3.217e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-215ENST00000541367 1575 ntTSL 529.93■■■□□ 2.387e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 HSF4-217ENST00000521916 404 ntTSL 329.21■■■□□ 2.277e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-213ENST00000540222 1400 ntTSL 527.1■■□□□ 1.937e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-216ENST00000541554 295 ntTSL 326.19■■□□□ 1.787e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-207ENST00000536995 4577 ntTSL 224.58■■□□□ 1.537e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-220ENST00000544490 3731 ntTSL 222.86■■□□□ 1.257e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)21.93■■□□□ 1.17e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.837e-8■■■■■ 27.8
PABPN1Q86U42 DDX41-213ENST00000512027 583 ntTSL 433.32■■■□□ 2.926e-7■■■■■ 27.7
PABPN1Q86U42 CPSF1-209ENST00000532725 597 ntTSL 239.17■■■■□ 3.867e-8■■■■■ 27.7
PABPN1Q86U42 RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 5751 ntTSL 225.27■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 27.6
PABPN1Q86U42 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.552e-7■■■■■ 27.6
PABPN1Q86U42 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.82■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 27.6
PABPN1Q86U42 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 27.6
PABPN1Q86U42 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 27.6
PABPN1Q86U42 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 27.6
PABPN1Q86U42 ABCA7-215ENST00000531478 725 ntTSL 340.02■■■■■ 41e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SRRT-212ENST00000487311 563 ntTSL 234.42■■■■□ 3.15e-9■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 DDX41-212ENST00000511040 721 ntTSL 327.79■■■□□ 2.046e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.336e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-205ENST00000503127 2734 ntTSL 1 (best)27.6■■■□□ 2.016e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.886e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.576e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-220ENST00000511937 2669 ntTSL 1 (best)22.3■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-204ENST00000503063 3232 ntTSL 219.56■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 SPATA20-208ENST00000504334 3539 ntTSL 219.33■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 INPPL1-202ENST00000320683 717 ntTSL 249.43■■■■■ 5.55e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 MAN2C1-233ENST00000566569 848 ntTSL 528.43■■■□□ 2.145e-7■■■■■ 27.5
PABPN1Q86U42 CHTF18-206ENST00000461268 814 ntTSL 535.21■■■■□ 3.239e-7■■■■■ 27.4
PABPN1Q86U42 CPSF1-201ENST00000526271 697 ntTSL 330.71■■■□□ 2.516e-8■■■■■ 27.4
PABPN1Q86U42 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 23e-7■■■■■ 27.3
PABPN1Q86U42 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)24.61■■□□□ 1.533e-7■■■■■ 27.3
PABPN1Q86U42 MRPL28-204ENST00000441883 800 ntTSL 555.7■■■■■ 6.517e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ABHD14A-ACY1-209ENST00000635952 853 ntTSL 341.01■■■■■ 4.162e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ABHD14A-ACY1-203ENST00000486081 1135 ntTSL 540.96■■■■■ 4.152e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ABHD14A-ACY1-222ENST00000637222 1048 ntTSL 539.02■■■■□ 3.842e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACY1-216ENST00000636556 1059 ntTSL 537.13■■■■□ 3.532e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACY1-222ENST00000637209 687 ntTSL 535.71■■■■□ 3.312e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACY1-225ENST00000637460 884 ntTSL 335.44■■■■□ 3.262e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.677e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACY1-224ENST00000637349 703 ntTSL 530.6■■■□□ 2.492e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 WDR46-233ENST00000461951 669 ntTSL 329.75■■■□□ 2.357e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 WDR46-235ENST00000473611 872 ntTSL 329.75■■■□□ 2.357e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACY1-223ENST00000637251 1739 ntTSL 529.03■■■□□ 2.242e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACY1-203ENST00000465121 1600 ntTSL 228.82■■■□□ 2.22e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.857e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ABHD14A-ACY1-211ENST00000636085 1188 ntTSL 525.94■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACY1-205ENST00000469863 755 ntTSL 324.13■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ABHD14A-ACY1-223ENST00000637461 566 ntTSL 521.66■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-203ENST00000525208 691 ntTSL 342.75■■■■■ 4.435e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-207ENST00000526469 1643 ntTSL 241.72■■■■■ 4.275e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.55e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-208ENST00000528475 2067 ntTSL 236.87■■■■□ 3.495e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-211ENST00000531184 2213 ntTSL 234.58■■■■□ 3.135e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-210ENST00000531173 854 ntTSL 234.45■■■■□ 3.115e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.865e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.215e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 GSDMD-202ENST00000524846 3462 ntTSL 222.19■■□□□ 1.145e-7■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 COL9A2-206ENST00000466267 835 ntTSL 538.95■■■■□ 3.836e-8■■■■■ 27.2
PABPN1Q86U42 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.993e-7■■■■■ 27.1
PABPN1Q86U42 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.621e-6■■■■■ 27.1
PABPN1Q86U42 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.391e-6■■■■■ 27.1
PABPN1Q86U42 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.321e-6■■■■■ 27.1
PABPN1Q86U42 NEURL4-209ENST00000573186 4431 ntTSL 516.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 27.1
PABPN1Q86U42 MMS19-212ENST00000444411 640 ntTSL 231.07■■■□□ 2.565e-8■■■■■ 27.1
PABPN1Q86U42 MMS19-218ENST00000485400 1513 ntTSL 228.9■■■□□ 2.225e-8■■■■■ 27.1
PABPN1Q86U42 DDX42-210ENST00000579539 571 ntTSL 212.28□□□□□ -0.443e-26■■■■■ 27
PABPN1Q86U42 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.761e-8■■■■■ 27
PABPN1Q86U42 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.521e-8■■■■■ 27
PABPN1Q86U42 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.35■■■■■ 5.492e-14■■■■■ 26.8
PABPN1Q86U42 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.762e-14■■■■■ 26.8
PABPN1Q86U42 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.72e-14■■■■■ 26.8
PABPN1Q86U42 DMAP1-215ENST00000494092 681 ntTSL 333.66■■■□□ 2.981e-7■■■■■ 26.8
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