Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
PPRC1Q5VV67 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
PPRC1Q5VV67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PPRC1Q5VV67 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PPRC1Q5VV67 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PPRC1Q5VV67 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PPRC1Q5VV67 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PPRC1Q5VV67 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PPRC1Q5VV67 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PPRC1Q5VV67 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PPRC1Q5VV67 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PPRC1Q5VV67 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PPRC1Q5VV67 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PPRC1Q5VV67 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PPRC1Q5VV67 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PPRC1Q5VV67 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PPRC1Q5VV67 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
PPRC1Q5VV67 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PPRC1Q5VV67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
PPRC1Q5VV67 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
PPRC1Q5VV67 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
PPRC1Q5VV67 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PPRC1Q5VV67 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
PPRC1Q5VV67 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PPRC1Q5VV67 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PPRC1Q5VV67 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PPRC1Q5VV67 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PPRC1Q5VV67 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
PPRC1Q5VV67 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
PPRC1Q5VV67 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PPRC1Q5VV67 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms