Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SPECC1Q5M775 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPECC1Q5M775 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SPECC1Q5M775 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SPECC1Q5M775 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SPECC1Q5M775 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPECC1Q5M775 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPECC1Q5M775 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPECC1Q5M775 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPECC1Q5M775 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPECC1Q5M775 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms