Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUW0

KRBOX4, KRAB domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX4Q5JUW0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRBOX4Q5JUW0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRBOX4Q5JUW0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRBOX4Q5JUW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRBOX4Q5JUW0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRBOX4Q5JUW0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms