Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNRNP35Q16560 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRNP35Q16560 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNRNP35Q16560 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNRNP35Q16560 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRNP35Q16560 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNRNP35Q16560 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
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