Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 66.5
PABPC4Q13310 SLC25A4-202ENST00000491736 1666 ntTSL 524.89■■□□□ 1.582e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.53e-25■■■■■ 66.3
PABPC4Q13310 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-14■■■■■ 66.2
PABPC4Q13310 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-14■■■■■ 66.2
PABPC4Q13310 ACTR6-213ENST00000553038 2045 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.884e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-204ENST00000548180 1747 ntTSL 28.22□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.764e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 SWI5-202ENST00000372898 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.03■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 SWI5-203ENST00000418976 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 COPS4-202ENST00000503682 1702 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 COPS4-206ENST00000509093 2273 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.469e-8■■■■■ 65.3
PABPC4Q13310 TMED1-202ENST00000586835 713 ntTSL 216.1■□□□□ 0.179e-8■■■■■ 65.3
PABPC4Q13310 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.1-203ENST00000417221 508 ntTSL 416.8■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.1-201ENST00000556904 563 ntTSL 414.46□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.1-202ENST00000557804 2159 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.52□□□□□ -1.533e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 PABPC1-217ENST00000521067 492 ntTSL 324.79■■□□□ 1.561e-323■■■■■ 64.9
PABPC4Q13310 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.531e-323■■■■■ 64.6
PABPC4Q13310 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.047e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.227e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-208ENST00000471185 598 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.857e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.057e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-209ENST00000474230 666 ntTSL 37.44□□□□□ -1.227e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 PRKCH-216ENST00000555542 521 ntTSL 429.61■■■□□ 2.332e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.882e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-213ENST00000444226 701 ntTSL 326.28■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-205ENST00000485896 1429 ntTSL 224.79■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-219ENST00000555906 459 ntTSL 324.1■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-203ENST00000469781 2256 ntTSL 223.2■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-220ENST00000497932 1495 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 TRIM56-202ENST00000412507 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.58■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-217ENST00000483937 1603 ntTSL 222.28■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-208ENST00000636461 5083 ntTSL 519.96■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-212ENST00000574985 2318 ntTSL 219.7■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-202ENST00000344592 2565 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-214ENST00000575679 757 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-203ENST00000423832 2040 ntTSL 517.77■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-206ENST00000561633 603 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-207ENST00000553831 545 ntTSL 417.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-207ENST00000561721 637 ntTSL 216.41■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-206ENST00000553830 514 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-204ENST00000472617 3554 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-218ENST00000496063 892 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SNHG20-203ENST00000565256 1234 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 CDK5-205ENST00000487703 922 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-206ENST00000637088 6740 ntTSL 513.99□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-201ENST00000638115 4453 ntTSL 513.37□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-205ENST00000638079 3146 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-207ENST00000497742 1743 ntTSL 512.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-207ENST00000638014 4510 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-226ENST00000557585 938 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-205ENST00000570752 3721 ntTSL 212.16□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 RPS28P7-201ENST00000473748 210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-209ENST00000420643 984 ntTSL 511.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-213ENST00000555185 582 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-222ENST00000556778 545 ntTSL 410.38□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 RNASEH2B-205ENST00000495244 971 ntTSL 58.69□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-205ENST00000553726 545 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-204ENST00000553265 552 ntTSL 47.95□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 RNASEH2B-207ENST00000613449 3328 ntTSL 27.85□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-220ENST00000556164 429 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-208ENST00000564414 528 ntTSL 1 (best)7.04□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PIP5K1B-207ENST00000478500 3335 ntTSL 1 (best)6.04□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 64.2
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 602.3 ms