RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615713.4

NICN1-208, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene NICN1, Length 1,921 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-208ENST00000615713 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.9■■■□□ 2.22
NICN1-208ENST00000615713 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.78■■□□□ 1.72
NICN1-208ENST00000615713 ABCC9O60706 1549 aa25.5■■□□□ 1.67
NICN1-208ENST00000615713 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.4■■□□□ 1.5
NICN1-208ENST00000615713 NACADO15069 1562 aa24.31■■□□□ 1.48
NICN1-208ENST00000615713 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.31■■□□□ 1.48
NICN1-208ENST00000615713 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
NICN1-208ENST00000615713 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
NICN1-208ENST00000615713 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.89■■□□□ 1.41
NICN1-208ENST00000615713 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.81■■□□□ 1.4
NICN1-208ENST00000615713 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
NICN1-208ENST00000615713 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.65■■□□□ 1.38
NICN1-208ENST00000615713 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.61■■□□□ 1.37
NICN1-208ENST00000615713 SCRIBQ14160 1630 aa23.53■■□□□ 1.36
NICN1-208ENST00000615713 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.41■■□□□ 1.34
NICN1-208ENST00000615713 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
NICN1-208ENST00000615713 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.04■■□□□ 1.28
NICN1-208ENST00000615713 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.94■■□□□ 1.26
NICN1-208ENST00000615713 SMARCA4P51532 1647 aa22.47■■□□□ 1.19
NICN1-208ENST00000615713 NCAPD3P42695 1498 aa22.44■■□□□ 1.18
NICN1-208ENST00000615713 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NICN1-208ENST00000615713 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.43■■□□□ 1.18
NICN1-208ENST00000615713 SMARCA2P51531 1590 aa22.39■■□□□ 1.17
NICN1-208ENST00000615713 HMGXB3Q12766 1538 aa22.31■■□□□ 1.16
NICN1-208ENST00000615713 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.27■■□□□ 1.16
NICN1-208ENST00000615713 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.26■■□□□ 1.15
NICN1-208ENST00000615713 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NICN1-208ENST00000615713 ERCC6Q03468 1493 aa22.01■■□□□ 1.11
NICN1-208ENST00000615713 WIZO95785 1651 aa22.01■■□□□ 1.11
NICN1-208ENST00000615713 NESP48681 1621 aa21.98■■□□□ 1.11
NICN1-208ENST00000615713 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NICN1-208ENST00000615713 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.89■■□□□ 1.1
NICN1-208ENST00000615713 CUX2O14529 1486 aa21.84■■□□□ 1.09
NICN1-208ENST00000615713 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.79■■□□□ 1.08
NICN1-208ENST00000615713 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.77■■□□□ 1.08
NICN1-208ENST00000615713 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NICN1-208ENST00000615713 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.69■■□□□ 1.06
NICN1-208ENST00000615713 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NICN1-208ENST00000615713 CFTRP13569 1480 aa21.61■■□□□ 1.05
NICN1-208ENST00000615713 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.54■■□□□ 1.04
NICN1-208ENST00000615713 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.54■■□□□ 1.04
NICN1-208ENST00000615713 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.54■■□□□ 1.04
NICN1-208ENST00000615713 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.52■■□□□ 1.03
NICN1-208ENST00000615713 WDR62O43379 1518 aa21.48■■□□□ 1.03
NICN1-208ENST00000615713 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.46■■□□□ 1.03
NICN1-208ENST00000615713 PRDM2Q13029 1718 aa21.37■■□□□ 1.01
NICN1-208ENST00000615713 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
NICN1-208ENST00000615713 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
NICN1-208ENST00000615713 TOPBP1Q92547 1522 aa21.15■□□□□ 0.98
NICN1-208ENST00000615713 ABCC8Q09428 1581 aa21.15■□□□□ 0.98
NICN1-208ENST00000615713 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.1■□□□□ 0.97
NICN1-208ENST00000615713 IFT140Q96RY7 1462 aa21.09■□□□□ 0.97
NICN1-208ENST00000615713 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
NICN1-208ENST00000615713 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
NICN1-208ENST00000615713 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
NICN1-208ENST00000615713 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
NICN1-208ENST00000615713 OSCARQ8IYS5 282 aa20.92■□□□□ 0.94
NICN1-208ENST00000615713 CUX1P39880 1505 aa20.9■□□□□ 0.94
NICN1-208ENST00000615713 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.89■□□□□ 0.93
NICN1-208ENST00000615713 SOGA1O94964 1423 aa20.88■□□□□ 0.93
NICN1-208ENST00000615713 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.88■□□□□ 0.93
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NICN1-208ENST00000615713 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
NICN1-208ENST00000615713 WDR97A6NE52 1622 aa20.76■□□□□ 0.91
NICN1-208ENST00000615713 FBLN2P98095 1184 aa20.71■□□□□ 0.91
NICN1-208ENST00000615713 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
NICN1-208ENST00000615713 CHD1O14646 1710 aa20.68■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 TRIM41Q8WV44 630 aa20.68■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.67■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 GRIN2BQ13224 1484 aa20.67■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.67■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 TOP2BQ02880 1626 aa20.66■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.65■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 SYNJ1O43426 1573 aa20.64■□□□□ 0.9
NICN1-208ENST00000615713 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.64■□□□□ 0.89
NICN1-208ENST00000615713 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
NICN1-208ENST00000615713 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NICN1-208ENST00000615713 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.59■□□□□ 0.89
NICN1-208ENST00000615713 PBRM1Q86U86 1689 aa20.58■□□□□ 0.88
NICN1-208ENST00000615713 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.57■□□□□ 0.88
NICN1-208ENST00000615713 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.57■□□□□ 0.88
NICN1-208ENST00000615713 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.57■□□□□ 0.88
NICN1-208ENST00000615713 SYNJ2O15056 1496 aa20.57■□□□□ 0.88
NICN1-208ENST00000615713 ARHGEF11O15085 1522 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-208ENST00000615713 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.46■□□□□ 0.87
NICN1-208ENST00000615713 ADAMTS12P58397 1594 aa20.42■□□□□ 0.86
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NICN1-208ENST00000615713 KIF27Q86VH2 1401 aa20.3■□□□□ 0.84
NICN1-208ENST00000615713 CEP170Q5SW79 1584 aa20.29■□□□□ 0.84
NICN1-208ENST00000615713 IGF1RP08069 1367 aa20.22■□□□□ 0.83
NICN1-208ENST00000615713 CUL7Q14999 1698 aa20.18■□□□□ 0.82
NICN1-208ENST00000615713 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.17■□□□□ 0.82
NICN1-208ENST00000615713 SHROOM2Q13796 1616 aa20.16■□□□□ 0.82
NICN1-208ENST00000615713 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.13■□□□□ 0.81
NICN1-208ENST00000615713 JPH4Q96JJ6 628 aa20.12■□□□□ 0.81
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