RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.26■■■■■ 7.24
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.88■■■■■ 6.22
PRKCH-216ENST00000555542 ABCC9O60706 1549 aa53.37■■■■■ 6.13
PRKCH-216ENST00000555542 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.05■■■■■ 5.76
PRKCH-216ENST00000555542 NACADO15069 1562 aa50.79■■■■■ 5.72
PRKCH-216ENST00000555542 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.77■■■■■ 5.72
PRKCH-216ENST00000555542 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.2■■■■■ 5.63
PRKCH-216ENST00000555542 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.05■■■■■ 5.6
PRKCH-216ENST00000555542 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.88■■■■■ 5.58
PRKCH-216ENST00000555542 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.77■■■■■ 5.56
PRKCH-216ENST00000555542 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.77■■■■■ 5.56
PRKCH-216ENST00000555542 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.45■■■■■ 5.51
PRKCH-216ENST00000555542 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.44■■■■■ 5.5
PRKCH-216ENST00000555542 SCRIBQ14160 1630 aa49.18■■■■■ 5.46
PRKCH-216ENST00000555542 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.86■■■■■ 5.41
PRKCH-216ENST00000555542 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.31
PRKCH-216ENST00000555542 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.23■■■■■ 5.31
PRKCH-216ENST00000555542 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.01■■■■■ 5.28
PRKCH-216ENST00000555542 SMARCA4P51532 1647 aa46.92■■■■■ 5.1
PRKCH-216ENST00000555542 NCAPD3P42695 1498 aa46.82■■■■■ 5.09
PRKCH-216ENST00000555542 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.79■■■■■ 5.08
PRKCH-216ENST00000555542 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
PRKCH-216ENST00000555542 SMARCA2P51531 1590 aa46.74■■■■■ 5.07
PRKCH-216ENST00000555542 HMGXB3Q12766 1538 aa46.58■■■■■ 5.05
PRKCH-216ENST00000555542 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
PRKCH-216ENST00000555542 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.43■■■■■ 5.02
PRKCH-216ENST00000555542 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.4■■■■■ 5.02
PRKCH-216ENST00000555542 ERCC6Q03468 1493 aa46.12■■■■■ 4.97
PRKCH-216ENST00000555542 NESP48681 1621 aa45.97■■■■■ 4.95
PRKCH-216ENST00000555542 WIZO95785 1651 aa45.95■■■■■ 4.95
PRKCH-216ENST00000555542 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.76■■■■■ 4.92
PRKCH-216ENST00000555542 CUX2O14529 1486 aa45.75■■■■■ 4.91
PRKCH-216ENST00000555542 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
PRKCH-216ENST00000555542 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.49■■■■■ 4.87
PRKCH-216ENST00000555542 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.46■■■■■ 4.87
PRKCH-216ENST00000555542 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.45■■■■■ 4.87
PRKCH-216ENST00000555542 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
PRKCH-216ENST00000555542 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
PRKCH-216ENST00000555542 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.06■■■■■ 4.8
PRKCH-216ENST00000555542 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.06■■■■■ 4.8
PRKCH-216ENST00000555542 CFTRP13569 1480 aa45.04■■■■■ 4.8
PRKCH-216ENST00000555542 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.02■■■■■ 4.8
PRKCH-216ENST00000555542 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.99■■■■■ 4.79
PRKCH-216ENST00000555542 WDR62O43379 1518 aa44.91■■■■■ 4.78
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.85■■■■■ 4.77
PRKCH-216ENST00000555542 PRDM2Q13029 1718 aa44.75■■■■■ 4.75
PRKCH-216ENST00000555542 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
PRKCH-216ENST00000555542 TOPBP1Q92547 1522 aa44.19■■■■■ 4.66
PRKCH-216ENST00000555542 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
PRKCH-216ENST00000555542 ABCC8Q09428 1581 aa44.14■■■■■ 4.66
PRKCH-216ENST00000555542 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.09■■■■■ 4.65
PRKCH-216ENST00000555542 IFT140Q96RY7 1462 aa44.07■■■■■ 4.65
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
PRKCH-216ENST00000555542 OSCARQ8IYS5 282 aa43.77■■■■■ 4.6
PRKCH-216ENST00000555542 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
PRKCH-216ENST00000555542 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
PRKCH-216ENST00000555542 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
PRKCH-216ENST00000555542 CUX1P39880 1505 aa43.61■■■■■ 4.57
PRKCH-216ENST00000555542 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.6■■■■■ 4.57
PRKCH-216ENST00000555542 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.6■■■■■ 4.57
PRKCH-216ENST00000555542 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.59■■■■■ 4.57
PRKCH-216ENST00000555542 SOGA1O94964 1423 aa43.59■■■■■ 4.57
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM41Q8WV44 630 aa43.46■■■■■ 4.55
PRKCH-216ENST00000555542 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
PRKCH-216ENST00000555542 WDR97A6NE52 1622 aa43.35■■■■■ 4.53
PRKCH-216ENST00000555542 CHD1O14646 1710 aa43.35■■■■■ 4.53
PRKCH-216ENST00000555542 FBLN2P98095 1184 aa43.32■■■■■ 4.53
PRKCH-216ENST00000555542 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.21■■■■■ 4.51
PRKCH-216ENST00000555542 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.15■■■■■ 4.5
PRKCH-216ENST00000555542 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.15■■■■■ 4.5
PRKCH-216ENST00000555542 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.15■■■■■ 4.5
PRKCH-216ENST00000555542 GRIN2BQ13224 1484 aa43.15■■■■■ 4.5
PRKCH-216ENST00000555542 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.49
PRKCH-216ENST00000555542 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
PRKCH-216ENST00000555542 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.1■■■■■ 4.49
PRKCH-216ENST00000555542 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.08■■■■■ 4.49
PRKCH-216ENST00000555542 PBRM1Q86U86 1689 aa43.08■■■■■ 4.49
PRKCH-216ENST00000555542 TOP2BQ02880 1626 aa43.08■■■■■ 4.49
PRKCH-216ENST00000555542 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.08■■■■■ 4.49
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGEF11O15085 1522 aa43.06■■■■■ 4.48
PRKCH-216ENST00000555542 SYNJ1O43426 1573 aa43.04■■■■■ 4.48
PRKCH-216ENST00000555542 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
PRKCH-216ENST00000555542 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43■■■■■ 4.47
PRKCH-216ENST00000555542 SYNJ2O15056 1496 aa42.95■■■■■ 4.47
PRKCH-216ENST00000555542 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.79■■■■■ 4.44
PRKCH-216ENST00000555542 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.74■■■■■ 4.43
PRKCH-216ENST00000555542 ADAMTS12P58397 1594 aa42.65■■■■■ 4.42
PRKCH-216ENST00000555542 ARAP1Q96P48 1450 aa42.65■■■■■ 4.42
PRKCH-216ENST00000555542 GRIN2AQ12879 1464 aa42.59■■■■■ 4.41
PRKCH-216ENST00000555542 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
PRKCH-216ENST00000555542 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.54■■■■■ 4.4
PRKCH-216ENST00000555542 CEP170Q5SW79 1584 aa42.42■■■■■ 4.38
PRKCH-216ENST00000555542 NUP160Q12769 1436 aa42.38■■■■■ 4.38
PRKCH-216ENST00000555542 KIF27Q86VH2 1401 aa42.28■■■■■ 4.36
PRKCH-216ENST00000555542 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
PRKCH-216ENST00000555542 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.17■■■■■ 4.34
PRKCH-216ENST00000555542 SHROOM2Q13796 1616 aa42.16■■■■■ 4.34
PRKCH-216ENST00000555542 CUL7Q14999 1698 aa42.12■■■■■ 4.33
PRKCH-216ENST00000555542 IGF1RP08069 1367 aa42.12■■■■■ 4.33
PRKCH-216ENST00000555542 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.05■■■■■ 4.32
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