Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1CBP62140 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1CBP62140 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1CBP62140 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CBP62140 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1CBP62140 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms