Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YBEYP58557 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YBEYP58557 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
YBEYP58557 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
YBEYP58557 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
YBEYP58557 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
YBEYP58557 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
YBEYP58557 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
YBEYP58557 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YBEYP58557 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YBEYP58557 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YBEYP58557 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YBEYP58557 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
YBEYP58557 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YBEYP58557 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
YBEYP58557 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YBEYP58557 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YBEYP58557 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
YBEYP58557 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YBEYP58557 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YBEYP58557 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YBEYP58557 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YBEYP58557 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YBEYP58557 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YBEYP58557 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YBEYP58557 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YBEYP58557 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YBEYP58557 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
YBEYP58557 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
YBEYP58557 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
YBEYP58557 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
YBEYP58557 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
YBEYP58557 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
YBEYP58557 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
YBEYP58557 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
YBEYP58557 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
YBEYP58557 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
YBEYP58557 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YBEYP58557 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YBEYP58557 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
YBEYP58557 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YBEYP58557 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YBEYP58557 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
YBEYP58557 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YBEYP58557 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YBEYP58557 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YBEYP58557 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YBEYP58557 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
YBEYP58557 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YBEYP58557 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YBEYP58557 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBEYP58557 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBEYP58557 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBEYP58557 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBEYP58557 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBEYP58557 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YBEYP58557 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YBEYP58557 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YBEYP58557 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YBEYP58557 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YBEYP58557 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YBEYP58557 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YBEYP58557 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YBEYP58557 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YBEYP58557 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YBEYP58557 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YBEYP58557 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YBEYP58557 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBEYP58557 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBEYP58557 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBEYP58557 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YBEYP58557 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YBEYP58557 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
YBEYP58557 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBEYP58557 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBEYP58557 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YBEYP58557 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YBEYP58557 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
YBEYP58557 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
YBEYP58557 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
YBEYP58557 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
YBEYP58557 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
YBEYP58557 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YBEYP58557 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YBEYP58557 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YBEYP58557 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YBEYP58557 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBEYP58557 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBEYP58557 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBEYP58557 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBEYP58557 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
YBEYP58557 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBEYP58557 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBEYP58557 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBEYP58557 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBEYP58557 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBEYP58557 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBEYP58557 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBEYP58557 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
YBEYP58557 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms