Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT10P13645 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT10P13645 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT10P13645 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT10P13645 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT10P13645 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT10P13645 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT10P13645 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT10P13645 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT10P13645 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT10P13645 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT10P13645 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT10P13645 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT10P13645 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT10P13645 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT10P13645 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT10P13645 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT10P13645 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT10P13645 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT10P13645 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT10P13645 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT10P13645 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT10P13645 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT10P13645 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT10P13645 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT10P13645 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KRT10P13645 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT10P13645 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT10P13645 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT10P13645 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT10P13645 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT10P13645 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT10P13645 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT10P13645 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT10P13645 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT10P13645 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT10P13645 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT10P13645 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT10P13645 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT10P13645 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT10P13645 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT10P13645 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT10P13645 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT10P13645 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT10P13645 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT10P13645 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT10P13645 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT10P13645 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT10P13645 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT10P13645 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT10P13645 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT10P13645 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT10P13645 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT10P13645 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT10P13645 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT10P13645 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT10P13645 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT10P13645 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT10P13645 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT10P13645 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT10P13645 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT10P13645 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT10P13645 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT10P13645 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT10P13645 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT10P13645 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT10P13645 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT10P13645 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT10P13645 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT10P13645 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT10P13645 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT10P13645 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT10P13645 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT10P13645 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT10P13645 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT10P13645 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT10P13645 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT10P13645 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT10P13645 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT10P13645 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT10P13645 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT10P13645 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT10P13645 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT10P13645 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT10P13645 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT10P13645 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT10P13645 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT10P13645 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT10P13645 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT10P13645 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms