Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KRT10P13645 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
KRT10P13645 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
KRT10P13645 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KRT10P13645 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KRT10P13645 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KRT10P13645 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KRT10P13645 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KRT10P13645 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KRT10P13645 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KRT10P13645 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KRT10P13645 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KRT10P13645 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KRT10P13645 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KRT10P13645 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KRT10P13645 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KRT10P13645 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
KRT10P13645 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KRT10P13645 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KRT10P13645 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KRT10P13645 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KRT10P13645 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT10P13645 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT10P13645 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT10P13645 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT10P13645 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT10P13645 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT10P13645 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT10P13645 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT10P13645 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT10P13645 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KRT10P13645 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT10P13645 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT10P13645 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KRT10P13645 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KRT10P13645 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KRT10P13645 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KRT10P13645 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KRT10P13645 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KRT10P13645 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KRT10P13645 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KRT10P13645 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KRT10P13645 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KRT10P13645 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
KRT10P13645 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KRT10P13645 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KRT10P13645 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
KRT10P13645 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KRT10P13645 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KRT10P13645 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KRT10P13645 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KRT10P13645 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KRT10P13645 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KRT10P13645 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KRT10P13645 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KRT10P13645 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT10P13645 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KRT10P13645 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KRT10P13645 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT10P13645 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT10P13645 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT10P13645 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KRT10P13645 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KRT10P13645 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT10P13645 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT10P13645 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KRT10P13645 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KRT10P13645 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KRT10P13645 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
KRT10P13645 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KRT10P13645 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KRT10P13645 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KRT10P13645 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
KRT10P13645 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT10P13645 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT10P13645 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KRT10P13645 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KRT10P13645 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KRT10P13645 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT10P13645 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT10P13645 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KRT10P13645 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT10P13645 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KRT10P13645 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT10P13645 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT10P13645 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KRT10P13645 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT10P13645 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT10P13645 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
KRT10P13645 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT10P13645 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT10P13645 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT10P13645 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT10P13645 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT10P13645 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT10P13645 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT10P13645 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT10P13645 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT10P13645 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT10P13645 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms