Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN2P04844 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN2P04844 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN2P04844 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPN2P04844 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPN2P04844 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPN2P04844 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPN2P04844 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPN2P04844 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPN2P04844 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPN2P04844 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPN2P04844 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPN2P04844 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPN2P04844 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPN2P04844 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPN2P04844 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPN2P04844 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPN2P04844 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPN2P04844 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPN2P04844 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPN2P04844 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPN2P04844 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPN2P04844 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPN2P04844 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPN2P04844 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPN2P04844 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPN2P04844 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPN2P04844 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPN2P04844 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPN2P04844 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPN2P04844 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN2P04844 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN2P04844 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN2P04844 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN2P04844 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPN2P04844 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN2P04844 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN2P04844 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN2P04844 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPN2P04844 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN2P04844 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN2P04844 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN2P04844 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN2P04844 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN2P04844 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPN2P04844 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN2P04844 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN2P04844 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPN2P04844 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN2P04844 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN2P04844 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN2P04844 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPN2P04844 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPN2P04844 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN2P04844 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN2P04844 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPN2P04844 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPN2P04844 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN2P04844 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN2P04844 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPN2P04844 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN2P04844 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN2P04844 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPN2P04844 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPN2P04844 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPN2P04844 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPN2P04844 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN2P04844 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPN2P04844 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPN2P04844 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPN2P04844 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPN2P04844 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN2P04844 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPN2P04844 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN2P04844 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN2P04844 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN2P04844 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPN2P04844 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN2P04844 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPN2P04844 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN2P04844 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN2P04844 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN2P04844 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN2P04844 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN2P04844 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPN2P04844 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN2P04844 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN2P04844 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPN2P04844 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPN2P04844 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPN2P04844 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN2P04844 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN2P04844 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN2P04844 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPN2P04844 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN2P04844 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN2P04844 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN2P04844 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPN2P04844 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN2P04844 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms