Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TOP3BO95985 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TOP3BO95985 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOP3BO95985 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TOP3BO95985 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOP3BO95985 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOP3BO95985 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms