Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMUO75648 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMUO75648 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMUO75648 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMUO75648 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMUO75648 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMUO75648 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMUO75648 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMUO75648 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMUO75648 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMUO75648 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMUO75648 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMUO75648 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMUO75648 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMUO75648 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMUO75648 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMUO75648 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMUO75648 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMUO75648 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMUO75648 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMUO75648 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMUO75648 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMUO75648 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMUO75648 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMUO75648 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMUO75648 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMUO75648 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMUO75648 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMUO75648 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMUO75648 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMUO75648 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMUO75648 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMUO75648 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMUO75648 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMUO75648 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMUO75648 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRMUO75648 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRMUO75648 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMUO75648 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMUO75648 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMUO75648 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMUO75648 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMUO75648 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMUO75648 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMUO75648 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMUO75648 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMUO75648 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMUO75648 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMUO75648 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMUO75648 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMUO75648 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMUO75648 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMUO75648 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMUO75648 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMUO75648 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMUO75648 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMUO75648 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMUO75648 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMUO75648 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMUO75648 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMUO75648 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMUO75648 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMUO75648 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMUO75648 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMUO75648 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMUO75648 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMUO75648 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMUO75648 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMUO75648 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMUO75648 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMUO75648 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMUO75648 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMUO75648 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMUO75648 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMUO75648 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRMUO75648 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMUO75648 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMUO75648 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMUO75648 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRMUO75648 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMUO75648 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRMUO75648 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMUO75648 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRMUO75648 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMUO75648 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRMUO75648 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMUO75648 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMUO75648 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMUO75648 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRMUO75648 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMUO75648 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMUO75648 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMUO75648 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMUO75648 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMUO75648 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRMUO75648 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMUO75648 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMUO75648 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMUO75648 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMUO75648 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms