Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX3O60493 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX3O60493 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX3O60493 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX3O60493 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX3O60493 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX3O60493 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX3O60493 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX3O60493 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX3O60493 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX3O60493 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX3O60493 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX3O60493 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX3O60493 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX3O60493 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX3O60493 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX3O60493 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX3O60493 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX3O60493 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX3O60493 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX3O60493 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX3O60493 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX3O60493 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX3O60493 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX3O60493 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX3O60493 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX3O60493 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX3O60493 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX3O60493 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX3O60493 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX3O60493 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX3O60493 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX3O60493 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX3O60493 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX3O60493 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX3O60493 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX3O60493 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX3O60493 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX3O60493 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX3O60493 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX3O60493 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX3O60493 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX3O60493 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX3O60493 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX3O60493 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX3O60493 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX3O60493 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX3O60493 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX3O60493 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX3O60493 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX3O60493 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX3O60493 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX3O60493 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX3O60493 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX3O60493 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX3O60493 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX3O60493 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX3O60493 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX3O60493 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX3O60493 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX3O60493 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX3O60493 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX3O60493 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX3O60493 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX3O60493 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX3O60493 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX3O60493 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX3O60493 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX3O60493 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX3O60493 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX3O60493 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX3O60493 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX3O60493 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX3O60493 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX3O60493 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX3O60493 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX3O60493 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX3O60493 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX3O60493 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX3O60493 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX3O60493 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX3O60493 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX3O60493 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX3O60493 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX3O60493 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX3O60493 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX3O60493 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX3O60493 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX3O60493 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX3O60493 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX3O60493 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX3O60493 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX3O60493 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX3O60493 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX3O60493 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX3O60493 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX3O60493 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX3O60493 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX3O60493 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX3O60493 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms