Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNX3O60493 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNX3O60493 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SNX3O60493 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNX3O60493 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNX3O60493 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNX3O60493 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SNX3O60493 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SNX3O60493 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
SNX3O60493 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SNX3O60493 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SNX3O60493 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNX3O60493 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNX3O60493 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX3O60493 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SNX3O60493 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SNX3O60493 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SNX3O60493 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SNX3O60493 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SNX3O60493 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNX3O60493 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SNX3O60493 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SNX3O60493 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX3O60493 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX3O60493 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNX3O60493 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNX3O60493 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SNX3O60493 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX3O60493 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX3O60493 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX3O60493 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX3O60493 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNX3O60493 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNX3O60493 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX3O60493 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNX3O60493 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX3O60493 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX3O60493 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX3O60493 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SNX3O60493 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX3O60493 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SNX3O60493 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX3O60493 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX3O60493 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX3O60493 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX3O60493 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX3O60493 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX3O60493 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX3O60493 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNX3O60493 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX3O60493 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX3O60493 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX3O60493 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNX3O60493 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX3O60493 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX3O60493 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX3O60493 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX3O60493 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX3O60493 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX3O60493 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX3O60493 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SNX3O60493 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNX3O60493 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX3O60493 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX3O60493 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX3O60493 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX3O60493 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX3O60493 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX3O60493 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX3O60493 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX3O60493 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX3O60493 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX3O60493 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNX3O60493 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX3O60493 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX3O60493 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNX3O60493 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX3O60493 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNX3O60493 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNX3O60493 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNX3O60493 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNX3O60493 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNX3O60493 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX3O60493 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SNX3O60493 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX3O60493 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX3O60493 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX3O60493 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX3O60493 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX3O60493 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX3O60493 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX3O60493 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX3O60493 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX3O60493 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX3O60493 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNX3O60493 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNX3O60493 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX3O60493 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX3O60493 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNX3O60493 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms