Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MARCH6O60337 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MARCH6O60337 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MARCH6O60337 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MARCH6O60337 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MARCH6O60337 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MARCH6O60337 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms