Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SUV39H1O43463 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUV39H1O43463 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUV39H1O43463 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SUV39H1O43463 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SUV39H1O43463 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms