Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SUV39H1O43463 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SUV39H1O43463 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SUV39H1O43463 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SUV39H1O43463 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SUV39H1O43463 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SUV39H1O43463 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SUV39H1O43463 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SUV39H1O43463 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SUV39H1O43463 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SUV39H1O43463 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SUV39H1O43463 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SUV39H1O43463 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SUV39H1O43463 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
SUV39H1O43463 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SUV39H1O43463 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SUV39H1O43463 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SUV39H1O43463 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SUV39H1O43463 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SUV39H1O43463 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SUV39H1O43463 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SUV39H1O43463 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SUV39H1O43463 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SUV39H1O43463 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUV39H1O43463 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SUV39H1O43463 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUV39H1O43463 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SUV39H1O43463 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUV39H1O43463 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUV39H1O43463 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUV39H1O43463 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUV39H1O43463 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUV39H1O43463 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUV39H1O43463 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUV39H1O43463 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUV39H1O43463 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUV39H1O43463 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUV39H1O43463 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUV39H1O43463 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUV39H1O43463 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SUV39H1O43463 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SUV39H1O43463 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SUV39H1O43463 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SUV39H1O43463 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SUV39H1O43463 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SUV39H1O43463 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUV39H1O43463 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUV39H1O43463 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUV39H1O43463 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUV39H1O43463 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUV39H1O43463 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUV39H1O43463 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SUV39H1O43463 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUV39H1O43463 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUV39H1O43463 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUV39H1O43463 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SUV39H1O43463 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUV39H1O43463 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUV39H1O43463 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUV39H1O43463 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUV39H1O43463 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SUV39H1O43463 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUV39H1O43463 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUV39H1O43463 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUV39H1O43463 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUV39H1O43463 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUV39H1O43463 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUV39H1O43463 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUV39H1O43463 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUV39H1O43463 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SUV39H1O43463 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUV39H1O43463 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SUV39H1O43463 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUV39H1O43463 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SUV39H1O43463 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SUV39H1O43463 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SUV39H1O43463 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUV39H1O43463 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUV39H1O43463 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUV39H1O43463 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUV39H1O43463 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUV39H1O43463 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUV39H1O43463 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUV39H1O43463 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUV39H1O43463 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUV39H1O43463 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUV39H1O43463 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUV39H1O43463 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUV39H1O43463 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUV39H1O43463 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUV39H1O43463 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUV39H1O43463 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUV39H1O43463 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms