Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP99D6REC4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP99D6REC4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP99D6REC4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP99D6REC4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP99D6REC4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms