Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HMGB1P1B2RPK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HMGB1P1B2RPK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HMGB1P1B2RPK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HMGB1P1B2RPK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMGB1P1B2RPK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB1P1B2RPK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms